「教學、研究、服務」是國立大學醫學院附設醫院的三大基本任務，自開院以來，歷任院長應皆深深體認：附設醫院的經營與發展，必須三大任務並重，且應力求平衡。然而，只有短短二個字的每項任務，看似簡單，實則艱鉅而沈重。根據李茂雄教授之調查研究，我們醫院之臨床醫師，工作時間之分配比例大致為醫療服務：教學：研究60%：20%：20%，照顧病人是很費時費力的工作，自然會佔大部分的時間。在醫學院最近舉辦的一次Dialogue，有一位基礎學科教授說：「臨床同仁除了教學及研究被批評作的不夠好之外，在服務方面似乎也不怎麼好，最近和一些台南市醫界同仁談話，他們認為我們醫師的醫術不見得比他們高明。」可見，社會大眾對成大醫院醫師之期望，應當不只負有教學責任、研究能力，更重要的是，醫術是否比其它醫院之醫師高明，否則我們如何要求同業轉診病例來院？因此，您能說服務不重要嗎？以成大醫院啟用時，大部分的醫師都是非常年輕，假如不努力服務病人，藉由豐富的臨床病例的研究暨經驗的累積，來改善自己的醫術，如何讓同一地區的醫界同仁尊敬、佩服，進而把病例轉給您?!又如何增進自己的教學研究材料暨實力?!
眾所週知，成大醫院的會計制度為「作業基金制」，此種制度的內涵，簡言之，就是自給自足，所有支出必須仰賴自身收入而無任何政府財政的奧援。目前，本院預算項目中數入部分只有壹項由政府撥補，其意義在於用來補償大學醫院因從事教學與研究因而損失的一些醫療收入，名曰「教學研究補助款」；然而，近年來，由於政府經費的緊縮，本補助款之額度已逐年遞減，由民國八十一年的補助額8億多，佔當年醫院總預算額的45%，到九十一年的二億陸仟多萬元，僅佔總預算額的6.13%，這其中的差額則完全要由醫院自行由營收來補足。而從醫院開始啟用以來的會計報表中，我們可以發現，若沒有這筆教學研究補助款，我們的年度收支平衡將是赤字。因此本院（台大醫院亦同）強調營運的目的只在求“平衡”而 非“營利”。試想，在這種財務制度基礎下，教育部的教學研究補助款逐年下降（每年減少10%），加上健保給付政策又愈來愈苛，國立大學醫院若不學習企業化經營，難保不步入台汽、中船等國營事業的命運。
既然我們醫院預算總額的百分之九十四要我們自己賺來，人員的生產力自是重要課題。而績效獎金制度之實施，則是有鑑於公立醫院效率不佳，為激勵同仁而採行的一種手段，是由教育部統一核定，適用於三家國立大學醫院（台大、成大及台北護理學院），其中百分之七十分給醫師，另外百分之三十分給非醫師人員。在醫師方面，我們都知道，在醫學中心，負有教學、研究、服務三項任務，則醫師的收入應該照這三方面的頁獻度來分配，長庚醫院醫師的收入（並非某位同仁所說的獎金），係依照這三者在科部的貢獻度來給。而本院醫師的收入，大致上可分為兩部分，第一部分包括各級教員及主治醫師的薪資、年終獎金、不開業獎金、衛生加給及研究補助金等，這些是固定的，約佔所有收入的百分之七十五左右，這其中都是依照教師等級暨年資來換算的，已有考量教學及研究的比重。而第二部分就是績效獎金，是變動的，大約佔醫師收入的百分之二十五左右，假若這一部分錢之分配也再考慮教學及研究的比重，則有重覆計算之嫌，特別是對年輕醫師非常不公平，也會失去激勵的作用。
批評與鞭策是進步的動力，然而檢討的事實基礎則必須正確，以免有誤導或偏頗之虞。成大醫院還有再進步成長的空間，惟有群策群力才能加速興革，大家期待成大醫學中心進步、提昇的目標是一致的，願共勉之。